Poprvé se Kunratice připomínají v roce 1287 jako ves s tvrzí, která se jmenovala Chunratitz. Místní jméno Kunratice je odvozeno příponou -ice z osobního jména Kunrát a znamenalo "ves lidí Kunrátových".
V průběhu let 1918-1938 se obec rozrůstala, většina obyvatel dojížděla za zaměstnáním do Prahy, a tak zanikl původní zemědělský ráz obce. Okolí Kunratic, především Kunratický les a rybník Šeberák jsou dosud vyhledávaným výletním a rekreačním místem.
Dnem 1. ledna 1968 jsou Kunratice připojeny k hlavnímu městu Praha a zákonem z roku 1990 se stávají městskou částí Praha - Kunratice.
